BD Rhapsody的技术不再采用利用微流控孔道射出细胞和射出的磁珠碰撞进行单细胞捕获，而是采用CytoSeq特有的蜂窝板技术。该技术用20W+的微孔（远大于Input细胞数量），保证单孔中的单细胞捕获。在细胞捕获完成后，进行细胞裂解，细胞释放出的mRNA可以被polydT的beads在微孔中捕获。
BD Rhapsody Beads
由以下3部分组成：
1. CL（细胞标签,cell label）：一个磁珠上的CL序列相同，不同磁珠上的CL序列不同，从而达到区分细胞的作用；
2. UMI（unique molecular identifier）：一个磁珠上的引物UMI各不相同，用于区分不同的mRNA分子，避免PCR偏好性；
3. ploy dT：与mRNA 3‘端poly A互补配对，以捕获polyA尾的mRNA；
BD Rhapsody是利用铺满20万个直径50 μm微孔的微孔板和携带细胞标签（cell label）的直径35 μm磁性beads捕获细胞。将制备好的单细胞悬液铺至微孔板上，细胞靠自身重力沉降至微孔底部，沉降速度慢的死细胞和杂质在这一步会被冲洗掉；控制细胞数目，减少两个细胞落入一个微孔的现象（形成doublets）；接着将beads铺至微孔板，同样沉降至微孔板底部；冲洗掉多余的beads并加入细胞裂解液，细胞释放出的mRNA可以被polydT的beads在微孔中捕获。利用磁铁回收beads到单管中进行后续逆转录、建库等操作。
